Vyberieme položku ponuky Projekt ▸ Pridať zdrojový súbor. V Dialógovom okne vyberieme cieľ, do ktorého sa má súbor pridať a samotný súbor. Môžeme pridať aj niekoľko súborov súčasne. Ak to chceme urobiť, v dialógovom okne s výberom súborov vyberieme viacero súborov naraz buď pomocou klávesu Shift alebo Ctrl. Po kliknutí na Pridať sa súbory pridajú do projektu.

V predvolenom stave sa na pridávanie súborov do projektu použije súčasný editor súborov. Iný bežný spôsob, akým sa dá súbor pridať, je ten, že klikneme pravým tlačidlom v Prehliadači súborov a z kontextovej ponuky zvolíme Pridať do projektu.

Ak sa súbor, ktorý sme zvolili, už nachádza v projekte, program Anjuta ho druhýkrát nepridá. Miesto toho zobrazí upozornenie, že súbor už bol do projektu pridaný.

Ak súbor ktorý zvolíme nie je v priečinku projektu, program sa opýta, či chceme súbor skopírovať do priečinka cieľa. Program Anjuta nedokáže pridať taký súbor, ktorý je mimo priečinka cieľa bez toho, aby ho tam skopíroval.