LDAPv3 bol vyvinutý koncom deväťdesiatych rokov aby nahradil LDAPv2. LDAPv3 pridáva do LDAP nasledujúce funkcie:

• Silná autentifikácia a zabezpečenie dátových služieb cez SASL
• Certifikovaná autentifikácia a a zabezpečenie dátových služieb cez TLS (SSL)
• Internacionalizácia prostredníctvom použitia Unicode
• Referrals and Continuations
• Schema Discovery
• Rozšíriteľnosť (ovládanie, rozšírené operácie, a ďalšie)

LDAPv2 je históriou (RFC3494), pretože väčšina tak zvaných LDAPv2 implementácií (vrátane slapd(8)) nezodpovedajú technickej špecifikácii LDAPv2, a je tiež obmedzená podpora vzájomnej komunikácie medzi implementáciami, ktorý sa vyhlasujú za LDAPv2. Pretože LDAPv2 sa výrazne líši od LDAPv3, súčasné nasadenie LDAPv2 aj LDAPv3 je dosť problematické. Používaniu LDAPv2 by sme sa mali vyhýbať, preto je v predvolenom stave vypnuté.