Doplnky s nástrojmi pridávajú dodatočnú funkcionalitu do poznámok programu Tomboy.
Doplnok Spätné odkazy je v predvolenom stave povolený a umožňuje nám vidieť ktoré poznámky odkazujú na poznámku, na ktorú sa práve pozeráme.
Doplnok Export do HTML je v predvolenom stave povolený a umožňuje exportovať jednotlivé poznámky do HTML.
Keď chceme poznámku exportovať do HTML, klikneme na ikonu Nástroje na nástrojovej lište a zvolíme si Exportovať do HTML. Po vykonaní tejto akcie sa zobrazí dialógové okno slúžiace na uloženie poznámky. Zvolíme priečinok, do ktorého chceme poznámku uložiť a zmeníme názov poznámky v novom html formáte, v prípade, že ju chceme odlíšiť od názvu pôvodnej poznámky. Poznámka sa potom uloží ako súbor vo formáte HTML a automaticky sa zobrazí v prehliadači.
Rozšírenie Vložiť časovú značku je v predvolenom stave zakázané. Keď ho chceme povoliť, v predvoľbách programu Tomboy zvolíme rozšírenie Vložiť časovú značku, a potom klikneme na tlačidlo Povoliť.
Keď chceme vložiť časovú značku do svojich poznámok, klikneme na ikonu Nástroje na lište nástrojov a potom zvolíme Vložiť časovú značku alebo stlačíme Ctrl + D.
Doplnok Poznámka dňa je v predvolenom stave zakázaný. Keď ho chceme povoliť, v predvoľbách programu Tomboy zvolíme Poznámka dňa a potom klikneme na tlačidlo Povoliť.
Poznámka dňa vytvorí každý deň novú poznámku s názvom napríklad Dnes: Štvrtok, . Do poznámky sa automaticky pridajú riadky pre Úlohy a Schôdzky.
Doplnok Prehliadač priečinka s poznámkami sleduje poznámky v priečinku, v ktorom sú uložené poznámky programu Tomboy. Ak doplnok zistí zmeny v našich poznámkach, aplikuje tieto zmeny a tie sa zobrazia v našich poznámkach. Tento doplnok sa často používa spolu so synchronizačnými nástrojmi tretích strán, akým je napríklad Dropbox. Nastavovanie synchronizačných služieb od tretích strán, je mimo rámec tejto príručky.